MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 6897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009484	AGG	2	6	555091	555096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_009484	CATTTT	2	12	555112	555123	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1003	NC_009484	CGGC	2	8	555194	555201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_009484	GC	3	6	555209	555214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_009484	AGG	2	6	555238	555243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_009484	GGCG	2	8	555253	555260	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_009484	GCT	2	6	555284	555289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_009484	CGG	2	6	555318	555323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_009484	GCGG	2	8	556524	556531	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_009484	CCG	2	6	557538	557543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_009484	CGG	2	6	557566	557571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_009484	AGC	2	6	558624	558629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_009484	GAG	2	6	558635	558640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_009484	ATG	2	6	558676	558681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_009484	CCT	2	6	558702	558707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_009484	GCG	2	6	560243	560248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_009484	GCG	2	6	560345	560350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_009484	G	6	6	560366	560371	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_009484	ATG	2	6	560372	560377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_009484	TCT	2	6	560409	560414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_009484	AGG	2	6	560541	560546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_009484	CGCAC	2	10	564090	564099	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1023	NC_009484	TTTG	2	8	564163	564170	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_009484	CGG	2	6	564494	564499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_009484	CGG	2	6	564513	564518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_009484	GCC	2	6	564524	564529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_009484	CCGG	2	8	564535	564542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_009484	GCG	2	6	564589	564594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_009484	CAT	2	6	565572	565577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_009484	GAT	2	6	565603	565608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_009484	GCG	2	6	565622	565627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_009484	CCG	3	9	565660	565668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_009484	GGC	2	6	565686	565691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_009484	GC	3	6	570583	570588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_009484	GCG	2	6	570624	570629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_009484	GCCG	2	8	571305	571312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_009484	GAT	2	6	571322	571327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_009484	CCG	2	6	572125	572130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_009484	CGT	2	6	573098	573103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_009484	GC	3	6	573114	573119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_009484	GGGC	2	8	573866	573873	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_009484	GCG	2	6	573892	573897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_009484	GCC	2	6	574465	574470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_009484	GGC	2	6	574471	574476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_009484	GCG	2	6	574509	574514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_009484	CGGGG	2	10	574573	574582	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1047	NC_009484	CTG	2	6	574589	574594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_009484	CGG	2	6	574599	574604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_009484	CTC	2	6	575460	575465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_009484	GCG	2	6	576596	576601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_009484	GGC	2	6	576643	576648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_009484	CG	3	6	576697	576702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_009484	CCT	2	6	576747	576752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_009484	TCGT	2	8	576765	576772	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_009484	ACG	3	9	578704	578712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1057	NC_009484	CAC	2	6	579098	579103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_009484	GA	3	6	579168	579173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_009484	CGT	2	6	582621	582626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_009484	GGC	2	6	582634	582639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_009484	CGG	2	6	582655	582660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_009484	TAA	2	6	582693	582698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_009484	ACCGG	2	10	582719	582728	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1064	NC_009484	TGC	2	6	582737	582742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_009484	ATG	2	6	582763	582768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1067	NC_009484	CCT	2	6	585476	585481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_009484	CTG	2	6	585501	585506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_009484	ACG	2	6	585526	585531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_009484	AGA	2	6	585584	585589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_009484	AATC	2	8	589734	589741	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1072	NC_009484	GCG	2	6	590338	590343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_009484	CTGTTT	2	12	590361	590372	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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1081	NC_009484	TTCCG	2	10	594725	594734	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1087	NC_009484	ATCG	2	8	596512	596519	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1088	NC_009484	GAT	2	6	596520	596525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_009484	GAT	2	6	596566	596571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1092	NC_009484	CAG	2	6	597532	597537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_009484	GCG	2	6	597556	597561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_009484	GC	3	6	597575	597580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_009484	GCC	3	9	597634	597642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_009484	CCG	2	6	597647	597652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1101	NC_009484	CGA	2	6	601661	601666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_009484	TG	3	6	601681	601686	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_009484	CGC	2	6	601705	601710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_009484	GC	3	6	601721	601726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_009484	GC	3	6	601736	601741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_009484	CGT	3	9	601742	601750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1108	NC_009484	CGT	2	6	602866	602871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_009484	CGTC	2	8	602892	602899	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_009484	TGA	2	6	605830	605835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_009484	CG	3	6	605840	605845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_009484	GGT	2	6	605903	605908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_009484	CGGTT	2	10	605919	605928	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1114	NC_009484	GTC	2	6	605980	605985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_009484	AAT	2	6	605989	605994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_009484	ATG	2	6	606010	606015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_009484	TCTT	2	8	606061	606068	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_009484	CGA	2	6	606082	606087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_009484	ATT	3	9	606133	606141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_009484	GCC	2	6	607930	607935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_009484	CGC	2	6	607994	607999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_009484	GCG	2	6	608000	608005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_009484	TCG	2	6	608016	608021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_009484	CG	3	6	608025	608030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_009484	TGC	2	6	608055	608060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_009484	GC	3	6	608067	608072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_009484	GCCC	2	8	608085	608092	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1128	NC_009484	CACG	2	8	608133	608140	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_009484	CGTTC	2	10	612004	612013	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1130	NC_009484	AC	3	6	612021	612026	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_009484	ATC	2	6	613544	613549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_009484	GCC	2	6	613569	613574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_009484	CGT	2	6	613591	613596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_009484	GCCGGG	2	12	615332	615343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1265	NC_009484	GCC	2	6	672709	672714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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